Päätyypit: Näitä ovat biguanidit, alkoholit, fenolit, orgaaniset amiinit, pyridiinit, isotiatsolinonit ja muut.
Ominaisuudet: Niillä on nopea bakterisidinen vaikutus; niillä on kuitenkin suhteellisen huono lämpöstabiilisuus ja kestävyys, ja niillä voi olla tiettyjä haitallisia sivuvaikutuksia. Ne sitoutuvat helposti bakteeri- ja homesolukalvojen pinnalla oleviin anionisiin kohtiin tai reagoivat sulfhydryyliryhmien kanssa ja häiritsevät siten proteiinisynteesiä ja solukalvojärjestelmää, mikä estää tehokkaasti bakteerien ja homeiden lisääntymistä. Siitä huolimatta ne ovat alttiita hajoamaan ultraviolettivalon vaikutuksesta, mikä johtaa lyhyeen käyttöikään; lisäksi joillakin orgaanisilla antimikrobisilla aineilla voi olla myrkyllisiä sivuvaikutuksia.
Sovellukset: Tällä hetkellä laajimmin tutkitut ja käytetyt orgaaniset pinta-aktiiviset antimikrobiset aineet ovat typpeä- sisältävät kationiset yhdisteet,-kuten kvaternaariset ammoniumsuolat-, joita on käytetty laajasti antimikrobisissa pinnoitteissa.
